Sus amenazas más importantes son electrocución, envenenamiento, cacería ilegal, pérdida de hábitat, aumento de actividades forestales, perturbación humana de sus zonas de anidación, tráfico ilegal para su venta (mascotas o cetrería), y envenenamiento por plaguicidas.
El Águila real ha sido el símbolo del escudo nacional, oficialmente desde 1968, originado a partir de la leyenda azteca sobre la fundación de Tenochtitlán.